Originario di Caldas da Rainha, João Almeida si è fatto notare nel 2016, quando ha vinto i titoli nazionali in linea e a cronometro, una prestazione che ha ripetuto quest'anno tra gli U23. Nel mezzo, è diventato il primo corridore portoghese a vincere la Liegi-Bastogne-Liegi Under, ha concluso al settimo posto il Tour de l'Avenir e ha chiuso secondo al Giro Baby del 2018.
Su di lui la Deceuninck Quick-Step ha puntato i fari da tempo e ha trovato un accordo che lo vedrà diventare nel 2020 il primo corridore portoghese nella storia della squadra.

«La Deceuninck - Quick-Step è sempre stata la mia prima scelta e unirmi a loro è un sogno diventato realtà. L'atmosfera è fantastica e durante i camp ho potuto constatare che esiste un forte legame tra tutti - piloti e staff - e questo è un aspetto che mi piace molto. Non vedo l'ora di vivere mia prima stagione da professionista, spero di aiutare il team, di imparare e migliorare il più possibile» ha affermato il 21enne corridore attualmente in forza al team Hagens Berman Axeon.